Акопян Н.А., Харзинова В.Р., Чыдым С.М., Жучаев К.В., Костюнина О.В., Зиновьева Н.А.
DOI: 10.33284/2658-3135-102-4-132
УДК 636.4:636.082.11
Генетический анализ митохондриальной и ядерной ДНК свиней кемеровской породы
Н.А. Акопян1, В.Р. Харзинова1, С.М. Чыдым2, К.В. Жучаев2, О.В.Костюнина1, Н.А.Зиновьева1
1Федеральный научный центр животноводства-ВИЖ имени академика Л.К. Эрнста (п. Дубровицы, Московская обл.) 2Новосибирский государственный аграрный университет (г. Новосибирск)Аннотация. Кемеровская порода свиней – одна из локальных пород России. Основываясь на анализе полиморфизма контрольного региона мтДНК и 10 микросателлитных локусов, была проведена оценка уровня генетического разнообразия свиней пород кемеровская (n=33), ландрас (n=26), крупная белая (n=59) и дюрок (n=16). Осуществлённый кластерный анализ указывает на высокую степень генетической консолидированности исследуемых популяций. Полученные данные указывают, что кемеровские свиньи характеризуются относительно невысоким уровнем биоразнообразия. Гаплотипы митохондриальной ДНК свиней кемеровской породы более мономорфны и представлены в меньшем количестве, что, по всей видимости, обусловлено малым размером популяции и подтверждается значением среднего числа парных различий между гаплотипами исследованного фрагмента мтДНК (Hd=0,1794). Для свиней пород кемеровская, ландрас, дюрок и крупная белая уровень наблюдаемой гетерозиготности (Ho), рассчитанный с использованием микросателлитных локусов, составил 0,545; 0,555; 0,637 и 0,692 соответственно. Результаты проведённых исследований показывают, что для свиней кемеровской породы наблюдается снижение генетического разнообразия. Генетическое равновесие у всех изученных местных пород свиней смещено в сторону гетерозигот с ранжированием коэффициента инбридинга (Fis) 0,148 в КЕМ. Данные, полученные от кемеровских свиней по материнской линии и данных микросателлитов, показывают, что эта порода утратила генетическое разнообразие как в своих митохондриальных, так и в ядерных геномах.
Ключевые слова: свиньи, кемеровская порода, мтДНК, гаплотипы, микросателлиты, STR, генетическое разнообразие.
Акопян Наре Акоповна, младший научный сотрудник, Федеральный научный центр животноводства-ВИЖ имени академика Л.К. Эрнста, 142132, Московская область, г. о. Подольск, п. Дубровицы, дом 60, тел.: +79169163070, e-mail: parlenare@gmail.com
Харзинова Вероника Руслановна, кандидат биологических наук, ведущий научный сотрудник, Федеральный научный центр животноводства-ВИЖ имени академика Л.К. Эрнста, 142132, Московская область, г. о. Подольск, п. Дубровицы, дом 60, тел.: +19258790712, e-mail: veronika0784@mail.ru
Чыдым Сырга Мартооловна, аспирант, Новосибирский государственный аграрный университет, 630039, г. Новосибирск, ул. Добролюбова, 160, e-mail: chydym.syrga@yandex.ru
Жучаев Константин Васильевич, доктор биологических наук, профессор, декан биолого-технологического факультета, Новосибирский государственный аграрный университет, 630039, г. Новосибирск, ул. Добролюбова, 160, e-mail: nsau@inbox.ru
Костюнина Ольга Васильевна, доктор биологических наук, руководитель лаборатории молекулярных основ селекции, Федеральный научный центр животноводства-ВИЖ имени академика Л.К. Эрнста, 142132, Московская область, г.о. Подольск, п. Дубровицы, дом 60, тел.: +79037415635, e-mail: kostolan@yandex.ru
Зиновьева Наталья Анатольевна, доктор биологических наук, профессор, академик РАН, директор, Федеральный научный центр животноводства-ВИЖ имени академика Л.К. Эрнста, 142132, Московская область, г.о. Подольск, п. Дубровицы, дом 60, e-mail: zinovieva@mail.ru
Поступила в редакцию 30 октября 2019 г.; принята после решения редколлегии 16 декабря 2019 г.;
опубликована 31 декабря 2019 г.